1、产生耐药性

    滥用抗菌药物最大的危害就是细菌对抗菌药物产生广泛而迅速的耐药性。滥用抗菌药物的过程就是培养耐药性细菌的过程。细菌耐药性的产生和不断增加破坏生态环境，严重威胁人类身体健康和生命安全。

    2、引起菌群失调

    应用抗菌药物（特别是广谱抗生素）在杀灭致病菌的同时，也会对体内的正常菌群产生不同程度的影响，破坏人体内微生态环境的稳定，引起菌群失调、二重感染和造成内源性感染（医院感染），增加患者的痛苦，延长住院时间，增加病死率，增加医疗费支出。

    3、引起不良反应及药源性疾病发生

    滥用抗菌药物会引起许多不良反应及药源性疾病发生。如肝、肾损害，药物性营养不良等。抗菌药物产生的不良反应大都具有渐进性、积累性，故有隐蔽性，一时难以觉察，使患者病情加重，甚至发生致残或致死。

    4、浪费医药资源

    抗生素的生产有天然、半合成、合成3种方法，其中前两种都需粮食做培养基，同时新的抗生素价格昂贵，滥用造成资源浪费和医疗费用居高不下。

    5、我国滥用抗菌药物现象比较严重

    根据不完全统计，目前使用量、销售量排序在前15位的药品中，有10种是抗菌药物。我国住院患者抗菌药物的费用占总费用的50%以上（国外一般在15%～30%）。国内住院患者的抗生素使用率高达80%，其中使用广谱抗生素和联合使用的占58%，远远高于30%国际水平。